Группа австрийских исследователей, работающих под руководством доктора Maria Kalyna в Венском медицинском
университете (Medical University of Vienna, Austria), а также Университете природных ресурсов и наук
о жизни (University of Natural Resources and Life Sciences, Vienna, Austria) анонсировали открытие
нового типа функциональных элементов генома – экзитронов. О своем открытии авторы
сообщили в 25 томе журнала Genome Research за 2015 год (PubMed ID 25934563). Под экзитронами
(англ. exitrons, exonic introns) понимаются внутренние участки белок-кодирующих экзонов, которые могут
удаляться системой сплайсинга во время созревания мРНК. Поскольку они
располагаются непосредственно в белок-кодирующих участках гена, то удаление
таких последовательностей неминуемо влияет на структуру и функцию белка: нарушается
организация целых доменов или их участков, либо удаляются сайты для
пострансляционной модификации белков, что не может не сказаться на их
функциональности. По данным, полученным авторами открытия, сплайсинг экзитронов
является тканеспецифическим, активируется во время стресса и канцерогенеза,
может происходить у непрерывающихся (без интронов) генов, и наблюдается как у
растений, так и у животных (включая человека).
Блог посвящен проблемам организации и функционирования транскриптома эукариотических клеток: от сетевой организации систем контроля экспрессии генов до закономерностей сплайсинга. Особое внимание уделяется высокопроизводительным методам анализа транскриптома и методам обработки эмпирических данных. В частности, ряд сообщений посвящено методам геномного и полнотранскриптомного секвенирования и анализу полученных данных с помощью программных средств, созданных в среде программирования R.
Комментариев нет:
Отправить комментарий